Misiunea Grădinii Botanice Universitare din Târgu Mureș este aceea de a deține colecții de plante identificate (vii sau conservate) și de a le folosi în scopuri științifice, de conservare a fitodiversității și de educație.
Astfel, obiectivele urmărite pentru atingerea misiunii se referă la:
- oferirea de resurse pentru educația elevilor, profesorilor, studenților, dar și a publicului larg.
- conservarea diversității plantelor „ex situ” prin organizarea băncii de semințe și prin dezvoltarea colecțiilor vii.
Mai concret, perspectivele de viitor se referă la:
- Îmbunătățirea aspectului peisagistic al Grădinii Botanice, prin lucrări de reabilitare a mobilierului de grădină, a căilor de acces, sere, clădirile aferente.
- Dezvoltarea unei platforme electronice de evidență a informațiilor specifice Grădinii Botanice.
- Accesarea unor proiecte orientate către protecția și conservarea diversității plantelor.